Mamíferos
Mais de 2.650 mamíferos, no todo ou em parte, como esqueletos, naturalizados ou em álcool.
Três tipos de morcegos africanos descritos por Albert Monard, que também descreveu ou ajudou a descrever muitas espécies novas.
Graças à contribuição excecional deste antigo conservador, o Museu de História Natural é muito rico em fauna africana.
Coleção de referência de crânios (roedores, morcegos, mustelídeos, felídeos, etc.).
Aves
Mais de 4.900 aves, sob a forma de peles, esqueletos, fragmentos ou exemplares naturalizados.
Coleção de referência de peles e crânios.
Répteis
Mais de 1100 répteis, incluindo 6 tipos descritos por Albert Monard.
Anfíbios
Mais de 900 anfíbios, incluindo 6 tipos descritos por Albert Monard.
Peixe
Mais de 210 peixes, incluindo uma grande parte de Angola.
Insectos e outros invertebrados
Várias dezenas de milhares de invertebrados, incluindo cerca de 66.000 insectos.
Escorpiões, escaravelhos exóticos, numerosas borboletas.
Colecções de borboletas Joss, Anton Hirsiger, St. Urban LU; Fernand Vuilleumier, Tramelan, etc.
Geologia e mineralogia
Coleção Riccardo Crosilla: várias centenas de micromontes e outros minerais.
Paleontologia
Flora e fauna (Graptolitos, Trilobites e Braquiópodes) do Paleozoico (Cambriano – Siluriano – Devoniano – Carbonífero – Permiano)
Fauna Liássica (Cefalópodes, Bivalves e Braquiópodes) de diferentes regiões da Europa (Alemanha e França)
Existem também importantes colecções de arte naturalista (Paul Barruel, Robert Hainard, Walter Linsenmaier, Charles-Edouard Gogler, Georges Roessinger, Louis e Marie Favre, entre muitos outros).
