Mammifères
Plus de 2650 mammifères, en tout ou en partie, sous forme de squelette, naturalisés ou en alcool.
Trois types de chauves-souris africaines décrits par Albert Monard, qui a également décrit ou contribué à décrire de nombreuses espèces nouvelles. Grâce à l’apport exceptionnel de cet ancien conservateur, le Musée d’histoire naturelle est très riche en faune africaine.
Collection de référence de crânes (rongeurs, chauves-souris, mustélidés, félidés, etc.).
Oiseaux
Plus de 4900 oiseaux, sous forme de peaux, squelettes, fragments ou naturalisés. Collection de référence de peaux et de crânes.
Reptiles
Plus de 1100 reptiles, dont 6 types décrits par Albert Monard.
Amphibiens
Plus de 900 amphibiens, dont 6 types décrits par Albert Monard.
Poissons
Plus de 210 poissons, dont une importante part de poissons d’Angola.
Insectes, et autres invertébrés
Plusieurs dizaines de milliers d’invertébrés, dont environ 66’000 insectes. Scorpions, coléoptères exotiques, nombreux papillons.
Collections de papillons Joss, Anton Hirsiger, St.Urban LU; Fernand Vuilleumier, Tramelan, etc.
Géologie et minéralogie
Fonds Riccardo Crosilla : collection de plusieurs centaines de micromounts et autres minéraux.
Paléontologie
Flore et Faune (Graptolites, Trilobites et Brachiopodes) du Paléozoïque (Cambrien – Silurien – Dévonien – Carbonifère – Permien)
Faune liasique (Céphalopodes, Bivalves et Brachiopodes) de différentes régions d’Europe (Allemagne et France)
A cela s’ajoutent d’importants fonds d’art naturaliste (Paul Barruel, Robert Hainard, Walter Linsenmaier, Charles-Edouard Gogler, Georges Roessinger, Louis et Marie Favre, et bien d’autres encore)